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Questa linea guida non fornisce indicazioni specifiche in merito alla tempistica della raccolta di tre-cinque campioni di tradizione rettale, a parte la raccomandazione che la tradizione finale venga idealmente eseguita almeno sette giorni dopo l'ultima esposizione. Durante la nostra epidemia, la politica di screening consisteva in un singolo tampone rettale al momento del ricovero per escludere il portatore di VRE nei pazienti sospetti di VRE.
Dopo una leggera inumidimento, gli applicatori flessibili possono raccogliere residui da superfici di qualsiasi forma prima che il campione venga eluito per l'analisi. I dispositivi di campionamento a punta singola o doppia sfruttano un metodo molto meno dannoso rispetto al campionamento in massa. Pre-puliti per l'uso immediato, i tamponi di campionamento monouso garantiscono che i test rimangano incontaminati. La plastica monouso ha rivoluzionato il laboratorio di microbiologia, prestandosi in particolare all'analisi di superfici o aree inaccessibili delle apparecchiature e alla raccolta di campioni mobili da superfici epiteliali.
Sappiamo tutti quanto sia importante il monitoraggio ambientale per la sicurezza di un impianto di produzione alimentare. I programmi di monitoraggio ambientale mirano a individuare agenti patogeni e/o microbi indicatori che potrebbero proliferare nell'impianto di produzione e nelle aree circostanti, avvisandovi di eventuali problemi prima che si verifichi una potenziale contaminazione del prodotto. Il successo di tali applicazioni dipende non solo dall'implementazione e dai test costanti, ma anche dall'efficienza del campionamento dell'impianto. Di seguito sono riportati i 5 errori più comuni che i nostri esperti riscontrano nelle colture durante il campionamento e l'invio di tamponi e spugne per i test. In genere, avendo testine realizzate in materiali a maglia di poliestere, i tamponi per il campionamento presentano il livello più basso di particelle rilasciate e i tassi di recupero del campione più elevati.
Particolarmente degni di nota sono i virus che infettano i batteri, che possono modulare la composizione e la fisiologia del gruppo microbico all'interno del microbioma. Mentre la maggior parte della ricerca virale si è concentrata sul microbioma intestinale a causa della sua elevata carica microbica, anche il microbioma cutaneo può essere di grande interesse per il suo contributo alle patologie dermatologiche. Tuttavia, la valutazione del viroma cutaneo è metodologicamente complessa, almeno in parte a causa della bassa biomassa ottenuta dalle comuni procedure di campionamento non invasive, come il tampone. Infatti, recentemente è stata evidenziata la necessità di considerare le questioni metodologiche nella ricerca sul microbioma cutaneo. Inoltre, sia per i campioni di pelle che per quelli di ferite, l'analisi di comunità e le letture virali ottenute tramite sequenziamento approfondito di campioni di tamponi medici hanno confermato un miglioramento significativo con l'utilizzo della tecnica migliorata.
La riammissione di questi pazienti avveniva incessantemente e, sulla base dei dati storici, si stimava che circa 4.700 ricoveri all'anno sarebbero stati classificati come "sospetti di VRE". Secondo la norma, ciò avrebbe comportato l'esecuzione di 75.000-125.000 colture per individuare tutti i portatori.
La frazione batterica del microbioma è spesso l'obiettivo principale di tali ricerche, rivelando associazioni tra composizione del gruppo batterico o espressione genica e stati patologici. Tuttavia, negli ultimi tempi, anche la componente virale del microbioma ha guadagnato attenzione.
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