Raccolta diretta di macchie di sangue con tampone Copan Microfloq®

Utilizziamo questo processo anche per il trattamento di campioni scientifici, dimostrando un migliore recupero del DNA fagico per il sequenziamento e la caratterizzazione a valle. La caratterizzazione del microbioma cutaneo e delle ferite è di grande interesse biomedico, ma è ostacolata dalla bassa biomassa dei campioni tipici. Qui descriviamo una metodologia migliorata per l'acquisizione di DNA fagico e microbico da un singolo tampone cutaneo o da una ferita, caratterizziamo la resa del DNA in campioni modello e mostriamo l'utilità di questa strategia con campioni raccolti da una clinica specializzata in ferite.

Microtamponi detergenti ad alta precisione per la pulizia fine e tamponi normali per la pulizia generale, realizzati e confezionati in camera bianca di classe. La testina è termosaldata al corpo, evitando l'uso di colla o solventi. Questo riduce il rischio di contaminazione e riduce al minimo la dispersione di particelle. Le impugnature di "spugne" e prodotti simili devono essere rotte prima di inserire completamente la spugna in un sacchetto sterile. Se rimangono attaccate, altri microbi provenienti dalle mani, dall'ambiente, ecc. possono essere trasferiti, compromettendo il campione.

Questo rivestimento crea uno strato assorbente sottile che consente un rapido assorbimento del campione e l'eluizione di oltre il 90%. Le modifiche includono la conservazione della punta del tampone e del pellet dopo la centrifugazione, l'utilizzo di più strategie di lisi e la regolazione delle concentrazioni e dei volumi dei reagenti. Utilizzando questa tecnica, quantifichiamo l'arricchimento del DNA virale e completiamo le rese di DNA virale e batterico in campioni modello.

Ogni giorno scoprirai nuove offerte, disponibili solo online, sconti nei negozi e la possibilità di risparmiare ancora di più accumulando coupon. Ma dovrai affrettarti, perché questi micro-tamponi di alta qualità stanno per diventare uno dei best-seller più ambiti in men che non si dica. Pensa a quanto saranno invidiosi i tuoi amici quando dirai loro che hai acquistato i tuoi micro-tamponi su AliExpress.

Se si tenta di eseguire il tampone su una superficie ancora bagnata di disinfettante, si ridurrà la sensibilità del test e/o si creeranno interferenze che potrebbero influire sui risultati finali del test. I supporti in carta assorbente sono eccellenti per piccoli interventi chirurgici, le micro spazzole detergenti sono un'ottima scelta per la pulizia di strumenti chirurgici di grandi dimensioni e i nostri tamponi in schiuma funzionano bene come applicatori di solventi. Il nuovo design del tampone floccato in nylon presenta fili di nylon orientati e disposti perpendicolarmente all'asta, creando microcapillari che non solo migliorano la raccolta del campione, ma lo rilasciano anche in modo più efficace. Infine, è importante inviare i tamponi al laboratorio il più rapidamente possibile. Per la maggior parte dei test, è preferibile effettuare il prelievo in giornata, ma in casi particolari è possibile anche 24 ore; se sono necessari tempi più lunghi tra il campionamento e il test, sarà necessario eseguire prima un lavoro di convalida specifico.

Sia nel gruppo colonscopia che in quello ambulatoriale con IBD, i campioni fecali sono stati raccolti entro 5 giorni prima dell'accesso in ambulatorio. I campioni sono stati raccolti in contenitori sterili e conservati a -20 °C entro 2 ore dal prelievo e congelati fino ad analisi aggiuntive. Questo studio è stato strutturato come studio descrittivo per valutare l'applicabilità e la riproducibilità dei tamponi rettali e per confrontare i profili batterici risultanti con quelli dei campioni fecali e delle biopsie mucose. In primo luogo, ai pazienti sottoposti a colonscopia elettiva è stato chiesto di raccogliere le feci una settimana prima della procedura e tamponi rettali e biopsie sono stati prelevati durante la procedura. La punta floccata del tampone è rivestita con fibre di Nylon® spruzzate perpendicolarmente.

Per i campioni fecali, sono stati utilizzati 100-400 mg di feci come input per il protocollo di estrazione del DNA fecale della macchina easyMag, come descritto dal produttore. Per l'isolamento del DNA dai tamponi, è stato aggiunto un ml di tampone di lisi nucliSENS, contenente tiocianato di guanidina, a ogni fiala contenente la punta del tampone e la miscela è stata agitata a 1400 giri al minuto per 5 minuti.

Per un sottoinsieme di 14 tamponi congelati rapidamente, è stata valutata un'ulteriore fase di bead-beating. Per questi tamponi, dopo cinque minuti di agitazione a 1400 giri al minuto, la miscela è stata divisa in due parti. A una parte sono stati aggiunti circa cento µg di biglie di silice Zirconia 0,1 e la bead-beating è stata eseguita per 60 secondi. Successivamente, tutti i campioni sono stati centrifugati per quattro minuti a 12.000 g e aggiunti al contenitore easyMag. L'estrazione del DNA è stata eseguita sulla macchina easyMag con il protocollo Specifico A come descritto dal produttore.