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Il campionamento tramite tampone è meno efficace su superfici ruvide (ad esempio legno e cemento). Tuttavia, viene utilizzato nei tamponi pre-iniezione, negli interventi chirurgici, nei farmaci o nelle attrezzature di primo soccorso. Questi sono associati ad antisettici come clorexidina, cetrimide o disinfettanti simili all'alcol. I tamponi antisettici che contengono principi attivi e mostrano azioni mirate ed esplicite rientrano nella categoria dei prodotti medicali.
Tuttavia, ciò avrebbe richiesto il prelievo di più tamponi rispetto ai tre raccolti per questo studio. Inoltre, il sistema EasyMag per l'isolamento del DNA, così come è stato utilizzato in questo caso, è stato descritto come molto adatto per l'estrazione del DNA da campioni fecali.
Le strutture sanitarie che effettuano il campionamento dell'acqua dovrebbero far analizzare i propri campioni in un laboratorio che utilizzi metodi consolidati e protocolli di elevata qualità. I campioni d'acqua non sono "campioni statici" a temperatura ambiente; durante il trasporto possono verificarsi potenziali cambiamenti sia nel numero che nella tipologia delle popolazioni microbiche. Abbiamo utilizzato una rigorosa esecuzione secondo protocollo per tutte le procedure di questo studio, al fine di poter valutare l'impatto dei risultati isolati sull'analisi del microbiota. Ci sono ancora alcuni fattori aggiuntivi che potrebbero essere interessanti da valutare, come la valutazione di ulteriori regimi di conservazione o di altri metodi di isolamento del DNA.
Il campionamento tramite tampone può essere utilizzato per individuare contaminanti organici e inorganici (granuli di polvere, pesticidi dispersi in aria, metalli, residui di contaminanti e così via) in contrasto alle superfici. La tecnica è più efficace su superfici lisce come metallo, vetro, superfici verniciate e foglie.
Pertanto, le tecniche di tamponamento e i tamponi stessi devono garantire una raccolta ecocompatibile del campione, la sua successiva conservazione e, infine, il rilascio delle cellule bersaglio. Nel 2003, il Clinical Laboratory Standards Institute ha pubblicato M40-A, uno standard autorizzato per il controllo standard delle tecniche di trasporto microbiologico; ciò ha significato che, per la prima volta, i prodotti dei tamponi potevano essere confrontati e valutati utilizzando criteri stabiliti. I kit di prelievo buccale FTA vengono utilizzati per il prelievo e la valutazione del DNA, più comunemente da cellule buccali o sangue. La raccolta di campioni buccali tramite card FTA è indolore e relativamente semplice, e spesso rappresenta il metodo preferito. Esistono diverse tecniche di prelievo buccale, come spazzolini, tamponi, card FTA o IsoCode.
Tra tutte, le carte da gioco FTA sono quelle che hanno utilizzato principalmente questa strategia, e questo perché le carte FTA producono DNA più adatto alla PCR rispetto al tampone buccale. Inoltre, le carte buccali FTA proteggono il DNA anche dai raggi UV e contengono un reagente che lo immobilizza e lo stabilizza direttamente nella matrice della carta. Un tampone è un piccolo batuffolo di cotone utilizzato da un medico o da un infermiere per pulire una ferita o applicarvi una sostanza.
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