Hisopos con micropuntas

Caracterizamos el ensayo sumergiendo hisopos en fluido nasal sintético enriquecido con el virus, transfiriéndolos a un medio de transporte viral y muestreando un volumen de VTM para realizar el ensayo RT-LAMP sin equipo de extracción de ARN. El ensayo tiene un límite de detección de 50 copias de ARN por μL en la solución de VTM en 30 min.

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Los microhisopos son ideales para retirar pestañas individuales, limpiar pequeños errores de pegamento y aplicar sellador. Cuentan con una punta ultrafina y flexible que permite una aplicación precisa del producto en las extensiones de pestañas, sin residuos ni pelusas, a la vez que mantienen un ambiente estéril.

Por lo tanto, proponemos que el muestreo de la microbiota intestinal con heces o mediante hisopado rectal, sin preparación intestinal previa, sea probablemente el método más popular para analizar la microbiota real e intacta. El hisopado rectal es una técnica atractiva para muestrear la microbiota intestinal en el ámbito clínico, sin las desventajas de la recolección de heces o la toma de muestras de mucosa. Los sujetos no necesitan recolectar muestras fecales en casa, ni ser preparados ni someterse a procedimientos invasivos. La aplicabilidad del hisopado rectal se ve reforzada por su uso generalizado en la práctica clínica y su posibilidad de toma en cada visita.

Los perfiles son similares a los de las muestras fecales en pacientes sin preparación, especialmente para el filo Bacteroidetes. Sugerimos que los hisopos rectales pueden ser ideales para la investigación a gran escala y para aplicaciones clínicas rutinarias de la determinación del perfil de la microbiota. Si bien la correlación entre los perfiles de los hisopos y los perfiles fecales fue bastante alta en pacientes que no se sometieron a una preparación intestinal exhaustiva para la colonoscopia, la similitud entre los diferentes tipos de muestras fue notablemente menor en el grupo de colonoscopia. Probablemente, esto se debió al lavado intestinal preparatorio, que afectó significativamente el contenido intestinal.

Actualmente, el tipo de muestra más utilizado para la evaluación de la microbiota intestinal son las heces. El diagnóstico microbiano clásico en heces se centra en la gastroenteritis infecciosa. Sin embargo, para una evaluación más completa de la microbiota intestinal, el muestreo, el almacenamiento y el procesamiento de las muestras tienen un impacto significativo en el análisis de la composición resultante. La muestra ideal debe ser fácil de obtener de forma estandarizada, sin perturbaciones previas de la microbiota.

Demostramos además la eficacia de nuestro ensayo detectando el virus SARS-CoV-2 en 20 muestras médicas. Finalmente, presentamos un dispositivo portátil y en tiempo real para la detección del SARS-CoV-2 en muestras de VTM, utilizando un cartucho tridimensional de fabricación aditiva y un lector para smartphone. El sistema se probó con 10 muestras clínicas y detectó el SARS-CoV-2 en ellas, distinguiendo las muestras positivas de las negativas tras 30 minutos. Este trabajo demuestra una vía alternativa para el diagnóstico del SARS-CoV-2 que no requiere infraestructura de laboratorio estándar, en entornos donde el diagnóstico se basa en la selección de muestras. En este estudio, demostramos que los hisopos rectales proporcionan una buena técnica para generar perfiles de microbiota altamente reproducibles.

La pandemia de COVID-19 presenta un caso urgente de brecha entre la disponibilidad de diagnósticos de vanguardia y las necesidades actuales. A medida que los protocolos de ensayo y las secuencias de cebadores se vuelven ampliamente conocidos, muchos laboratorios realizan pruebas diagnósticas mediante técnicas como la RT-PCR o la amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa (RT-LAMP). En este artículo, presentamos un ensayo isotérmico RT-LAMP para la detección del virus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) y demostramos su eficacia en muestras médicas mediante un instrumento sencillo y accesible para el punto de atención.