مسحات الألياف الدقيقة

نُظهر أيضًا تحليلنا من خلال الكشف عن فيروسات SARS-CoV-2 من 20 عينة سريرية. وأخيرًا، نكشف عن نظام نقطة اتصال محمول وفوريّ للكشف عن SARS-CoV-2 من عينات VTM باستخدام خرطوشة ثلاثية الأبعاد مُصنّعة بشكل إضافي وقارئ يعمل على الهاتف الذكي. تم اختبار نظام نقطة الاتصال باستخدام 10 عينات سريرية، وتمكّن من الكشف عن SARS-CoV-2 من هذه العينات السريرية من خلال التمييز بين العينات الإيجابية والسلبية بعد 30 دقيقة. يُظهر هذا العمل مسارًا بديلًا لتشخيص SARS-CoV-2 لا يتطلب بنية تحتية مختبرية تقليدية، في البيئات التي يتطلب فيها التشخيص عند جمع العينات. في هذا البحث، أظهرنا أن مسحات المستقيم تُوفر طريقة ممتازة لتوفير أنماط ميكروبيوتا قابلة للتكرار بشكل كبير.

حاليًا، عادةً ما يجمع المرضى أنفسهم عينات البراز في منازلهم. هذا يُدخل تلوثًا محتملًا أثناء عملية الفرز، وتأخرًا زمنيًا قبل التجميد، وتجميدًا فوق -20 درجة مئوية، وذوبانًا أثناء نقلها إلى المختبر. تشير الأدلة إلى أن هذه المكونات قد تُحدث تباينًا كبيرًا بما يكفي لإعاقة التشخيص الميكروبي. البديل هو أخذ عينات مباشرة من الغشاء المخاطي المعوي عن طريق أخذ خزعات أثناء التنظير الداخلي. وبينما يُمكن جمع هذه العينات بأسلوب موحد للغاية، إلا أن الطبيعة التدخلية لإجراء أخذ العينات تمنع تطبيقه على نطاق واسع كأداة فحص أو متابعة.

لذلك، نقترح أن أخذ عينات من ميكروبات الأمعاء باستخدام البراز أو مسحة المستقيم، دون تحضير مسبق للأمعاء، هو على الأرجح المنهجية الأكثر شيوعًا لتحليل ميكروبات حقيقية غير مُعَرَّضة للاضطراب. تُعد مسحات المستقيم تقنية ممتازة لأخذ عينات من ميكروبات الأمعاء في بيئة طبية دون عيوب جمع البراز أو أخذ عينات من الغشاء المخاطي. لا يحتاج المرضى إلى جمع عينات البراز في المنزل، ولا يتطلب تحضيرًا مسبقًا أو إجراءات جراحية. تتجلى فائدة مسحات المستقيم في كونها شائعة الاستخدام في الطب، ويمكن أخذها في كل زيارة.

حاليًا، يُعدّ البراز على الأرجح النمط الأكثر شيوعًا لتقييم ميكروبات الأمعاء. تُركّز التشخيصات الميكروبية التقليدية على البراز على التهاب المعدة والأمعاء المعدي. ومع ذلك، لإجراء تقييم أشمل لميكروبات الأمعاء، فإنّ أخذ العينات وتخزينها ومعالجتها له تأثير كبير على تحليل التركيب الناتج. يجب أن يكون النمط المثالي سهل الحصول عليه بطريقة موحدة دون أي اضطراب سابق في ميكروبات الأمعاء.

تُشبه أنماط العينات البرازية لدى المرضى غير المُجهّزين، وخاصةً لدى شعبة العصوانيات. نقترح أن مسحات المستقيم قد تكون مُناسبة تمامًا للأبحاث واسعة النطاق وللأغراض الطبية الروتينية لتحديد أنماط ميكروبات الأمعاء. في حين أن ارتباط أنماط المسحات بأنماط البراز كان مرتفعًا نسبيًا لدى المرضى الذين لم يخضعوا لتحضير معوي مكثف لتنظير القولون، فإن التشابه بين أنواع الأنماط المختلفة انخفض بشكل ملحوظ في مجموعة تنظير القولون. على الأرجح، يُعزى ذلك إلى غسل الأمعاء التحضيري، والذي أثر بشكل واضح على محتوى الأمعاء.

بالإضافة إلى ذلك، قبل تنظير القولون، يجب تحضير المرضى بأنظمة مُليّنة صارمة، والتي ثبت أنها تُؤثر على ميكروبات الأمعاء. يمكن الحصول على مسحات المستقيم بسهولة، ويمكن حفظها فورًا بطريقة موحدة دون إحداث أي اضطراب مُسبق في ميكروبات الأمعاء. تُستخدم مسحات المستقيم بانتظام للكشف عن الميكروبات المقاومة، وقد أثبتت فعاليتها الكبيرة في هذا الغرض. يرتبط تكوين ميكروبات الأمعاء بالعديد من الحالات المرضية، وأبرزها مرض التهاب الأمعاء، والسمنة، وسوء التغذية.

ميّزنا الاختبار بغمس مسحات في سائل أنفي اصطناعي مُضاف إليه الفيروس، ونقل المسحة إلى وسط نقل الفيروس، وأخذ عينة من سائل نقل الفيروس (VTM) لإجراء اختبار RT-LAMP دون الحاجة إلى استخدام حزمة استخلاص الحمض النووي الريبوزي (RNA). يبلغ حد الكشف في الاختبار 50 نسخة من الحمض النووي الريبوزي لكل ميكرولتر بدقة سائل نقل الفيروس (VTM) خلال 30 دقيقة.

تُمثل جائحة كوفيد-19 حالةً طارئةً تُمثل فجوةً بين توافر أحدث وسائل التشخيص والاحتياجات الحالية. ومع انتشار بروتوكولات الفحص وتسلسلات البادئات، تُجري العديد من المختبرات فحوصات تشخيصية باستخدام تقنيات مثل تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي (RT-PCR) أو التضخيم الحراري المتساوي بوساطة حلقة النسخ العكسي (RT-LAMP). نُقدم في هذه المقالة تحليلًا حراريًا متساويًا باستخدام RT-LAMP للكشف عن فيروس كورونا 2 المُسبب لمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة (SARS-CoV-2)، ونُجري عليه اختبارًا على عينات طبية باستخدام أداة بسيطة وسهلة الاستخدام في نقطة الرعاية الصحية.