Микрофибровые тампоны

Мы также продемонстрировали наш анализ, обнаружив вирусы SARS-CoV-2 в 20 образцах. Наконец, мы представляем переносимую и работающую в режиме реального времени систему POC для обнаружения SARS-CoV-2 в образцах VTM с использованием аддитивно изготовленного трёхмерного картриджа и считывателя на базе смартфона. Система POC была протестирована с использованием 10 медицинских образцов и смогла обнаружить SARS-CoV-2 в этих образцах, отличая положительные образцы от отрицательных через 30 минут. Данная работа демонстрирует альтернативный подход к диагностике SARS-CoV-2, не требующий стандартной лабораторной инфраструктуры, в условиях, когда прогноз необходим на уровне сбора образцов. В данном исследовании мы показали, что ректальные мазки представляют собой отличный метод для получения высоковоспроизводимых профилей микробиоты.

В настоящее время пациенты обычно собирают образцы кала самостоятельно дома. Это приводит к потенциальному загрязнению на протяжении всего процесса, задержке замораживания, замораживанию при температуре выше −20 °C и размораживанию во время транспортировки в лабораторию. Имеются убедительные доказательства того, что эти факторы могут вносить достаточно значительные вариации, затрудняющие микробиологическую диагностику. Альтернативой является прямой отбор проб слизистой оболочки кишечника путем взятия биопсии во время эндоскопии. Хотя эти образцы можно собирать в строго стандартизированном порядке, инвазивный характер процедуры отбора проб препятствует ее массовому применению в качестве метода скрининга или контроля.

Поэтому мы предполагаем, что забор образцов кишечной микробиоты с помощью фекалий или ректального мазка без предварительной подготовки кишечника, вероятно, является популярным методом анализа настоящей, нетронутой микробиоты. Ректальные мазки — это прекрасный метод забора образцов кишечной микробиоты в медицинских условиях, лишенный недостатков, связанных с отбором образцов фекалий или взятием образцов слизистой оболочки. Пациентам не нужно собирать образцы кала дома, им не требуется специальная подготовка или инвазивные процедуры. Применимость ректальных мазков подчеркивается тем, что они уже широко используются в медицинской практике и могут быть взяты при каждом визите.

В настоящее время, вероятно, наиболее распространённым образцом для оценки кишечной микробиоты является фекалии. Классическая микробиологическая диагностика фекалий фокусируется на инфекционном гастроэнтерите. Однако для более полной оценки кишечной микробиоты отбор, хранение и обработка образцов оказывают решающее влияние на конечный результат оценки состава. Идеальный образец должен быть легко получен стандартизированным способом без предварительного нарушения состава микробиоты.

Профили очень похожи на профили образцов кала у неподготовленных пациентов, особенно в отношении типа Bacteroidetes. Мы предполагаем, что ректальные мазки могут быть идеально подходящими для масштабных исследований и для рутинного медицинского профилирования микробиоты. В то время как корреляция профилей мазков с профилями кала была довольно высокой у пациентов, не проходивших тщательную подготовку кишечника к колоноскопии, сходство между различными типами паттернов было заметно снижено в группе, прошедшей колоноскопию. Вероятнее всего, это было связано с подготовительным промыванием кишечника, которое, очевидно, повлияло на состав содержимого кишечника.

Кроме того, перед колоноскопией пациентам необходимо пройти курс интенсивной слабительной терапии, которая, как доказано, нарушает микробиоту кишечника. Ректальные мазки можно легко получить и сразу же сохранить в стандартном порядке, не нарушая микробиоту ранее. Ректальные мазки уже регулярно используются для скрининга резистентных микроорганизмов и доказали свою высокую эффективность в этом направлении. Состав кишечной микробиоты связан с многочисленными заболеваниями, в частности, с воспалительными заболеваниями кишечника, избыточным весом и недоеданием.

Мы охарактеризовали тест, погрузив тампоны в искусственную назальную жидкость, в которую был добавлен вирус, перенеся тампон в среду для транспортировки вируса и отобрав некоторое количество VTM для проведения анализа RT-LAMP без использования набора для экстракции РНК. Предел обнаружения теста составляет 50 копий РНК на мкл в разрешении VTM в течение 30 минут.

Пандемия COVID-19 стала настоящим вызовом, когда между доступностью передовых диагностических средств и текущими потребностями существует разрыв. По мере того, как протоколы анализа и последовательности праймеров становятся широко известными, многие лаборатории проводят диагностические исследования, используя методы, подобные ОТ-ПЦР или изотермической амплификации с обратной транскрипцией (RT-LAMP). В данной статье мы описываем изотермический анализ RT-LAMP для выявления вируса экстремального острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2) и демонстрируем его на образцах медицинских препаратов с помощью простого и доступного прибора, доступного в амбулаторных условиях.