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Français Les limites de l'étude incluent le transport à température ambiante, qui aurait pu entraîner une dégradation des échantillons. Cependant, nous avons démontré la stabilité des virus respiratoires à température ambiante jusqu'à 9 jours.5 Deuxièmement, l'auto-prélèvement à domicile se produisait souvent un jour après le prélèvement par le clinicien, ce qui conduisait probablement à des échantillons avec une charge virale plus faible. Troisièmement, de nombreux participants étaient des professionnels de santé, ce qui limitait probablement la généralisation à la population générale. Quatrièmement, les écouvillons prélevés par le clinicien sont un critère standard imparfait qui peut introduire un biais. Le prélèvement par écouvillonnage médio-nasal à domicile non supervisé était comparable au prélèvement par écouvillonnage nasopharyngé prélevé par le clinicien pour la détection du SARS-CoV-2 chez les patients symptomatiques, en particulier ceux présentant une masse virale plus élevée.
Les laboratoires de microbiologie clinique du BIDMC ont supervisé la collecte de données. Cette étude a été examinée et accréditée par le comité d'évaluation institutionnel du Beth Israel Deaconess Medical Center.
Durant cette pandémie en constante évolution, nous avons recruté 185 personnes se présentant pour un test de dépistage du SARS-CoV-2, dont 41 ont obtenu un résultat positif. Nous avons utilisé un système innovant d'auto-prélèvement d'écouvillons à domicile et des services de livraison rapide, évitant ainsi tout contact des participants avec le système de santé.
Les participants ont subi un test standard par écouvillonnage nasal et ont également prélevé leurs propres échantillons de salive. Sur les 1 939 paires de tests, 34 se sont révélés positifs au coronavirus. On a également recensé 14 cas où le virus a été détecté dans l'échantillon salivaire, mais pas dans l'échantillon nasal, et 22 cas où l'inverse était vrai. Parmi ces 13 personnes, 9 avaient effectué un prélèvement nasal le même jour, et seuls deux de ces tests se sont révélés positifs.
Le prélèvement nasal médian à domicile était comparable aux échantillons nasopharyngés prélevés par les cliniciens pour détecter le nouveau coronavirus chez les patients symptomatiques. Smith, qui n'a pas participé à l'étude, a souligné que la quasi-totalité des participants à l'étude étaient des professionnels de santé, ce qui signifie qu'ils étaient plus familiarisés avec l'administration des prélèvements nasaux que la moyenne. COVIDSwab est un essai adaptatif permettant d'évaluer l'efficacité des prototypes par rapport au groupe témoin.
Les participants suspectés scientifiquement de COVID-19 et devant subir un test clinique standard de RT-PCR du SARS-CoV-2 avec un écouvillon témoin ont également été invités à subir un prélèvement ultérieur avec un seul prototype. Les prototypes ont été collectés dans un tube conique de 15 ml en VTM, transportés vers les laboratoires cliniques, conservés à 4 °C et testés jusqu'à l'obtention d'au moins 10 résultats positifs et 10 résultats négatifs sur les écouvillons témoins. Le prélèvement des échantillons a été effectué par des infirmiers qualifiés ou du personnel inhalothérapeute (« équipe de recherche ») supervisés par le service de pneumologie du Beth Israel Deaconess Medical Center.
Cependant, les treize tests salivaires ont été confirmés ultérieurement par des prélèvements nasopharyngés supplémentaires. Dans l'une des nouvelles études, une équipe de Yale a identifié 70 patients hospitalisés atteints de la COVID-19 dont l'infection avait été confirmée par les prélèvements nasopharyngés classiques. Chaque fois qu'un professionnel de santé effectuait des prélèvements nasaux supplémentaires, les chercheurs demandaient aux patients de se soumettre également à un test salivaire. De plus, ils ont prélevé des échantillons de salive et de prélèvements nasopharyngés auprès de 495 soignants asymptomatiques.
La semaine dernière, la Food and Drug Administration (FDA) a présenté un nouvel écouvillon, homologué, qui permettrait à terme aux personnes de prélever leurs propres échantillons pour des tests de diagnostic du coronavirus à domicile. L'entreprise fabriquant ces écouvillons, US Cotton, affirme ne pas encore être prête. Cette semaine, les écouvillons sont testés sur des sujets humains qui recevront un écouvillon standard dans une narine et un prototype de l'écouvillon conçu par Wyss dans l'autre. Parmi les participants, 41 (22,2 %) ont été testés positifs au SARS-CoV-2.
Ces résultats s'ajoutent à ceux d'études antérieures, qui se sont concentrées sur les tests salivaires de patients symptomatiques ou hospitalisés et ont montré que les analyses salivaires pouvaient être plus délicates. Une entreprise du comté de Piscataquis, fabricant d'écouvillons pour tests médicaux, est au cœur de l'effort national visant à intensifier les tests de dépistage du coronavirus, qui a infecté plus de 200 000 personnes à travers le monde. Cela signifie que le matériau de l'écouvillon n'interfère pas avec les fonctions en aval, telles que la PCR et les tests basés sur le séquençage. Les échantillons prélevés avec des écouvillons en fibre synthétique, en coton avec tige en plastique ou en bois et en alginate de calcium peuvent tous être utilisés avec une efficacité quasi équivalente pour le séquençage de nouvelle génération et la PCR, comme l'ont validé Mawi DNA Technologies et ses collaborateurs.
En raison de l'instabilité de l'ARN, l'utilisation de salive brute nécessite un transport rapide vers un laboratoire pour l'extraction du matériel viral et l'analyse de la réponse en chaîne par polymérase. L'étude se distingue par l'utilisation d'un nouvel équipement de prélèvement contenant un conservateur et un liquide viricide, permettant un stockage et un transport sûrs des échantillons. L'étude a démontré la faisabilité d'un outil de prélèvement simple et sûr pour la détection salivaire du SARS-CoV-2 dans le cadre d'un centre de dépistage de la COVID-19. Les chercheurs ont conclu que, malgré un taux de détection estimé inférieur à celui des tests par écouvillonnage, les tests salivaires pourraient présenter un intérêt particulier pour les populations éloignées, vulnérables ou difficiles. Ainsi, les chercheurs ont constaté que les méthodes diagnostiques standard par écouvillonnage nasopharyngé et oropharyngé détectaient davantage de cas de COVID-19 que les tests salivaires chez les patients asymptomatiques mais à risque élevé ou présentant des symptômes légers.
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