Est-il mauvais d’utiliser des cotons-tiges dans vos oreilles ?

Français La principale limite de l'étude est la taille relativement petite de l'échantillon, ce qui expliquerait la concordance de 100 % entre les écouvillons. Cependant, nous pensons qu'une éventuelle discordance entre les écouvillons dans une étude avec une grande taille d'échantillon pourrait être liée à la variabilité liée à la procédure d'échantillonnage plutôt qu'au type d'écouvillons. Bien que nos résultats montrent que le coton n'inhibe pas la détection du SARS-CoV-2, des travaux antérieurs ont montré une inhibition par les substances chimiques présentes dans la tige en bois de certains écouvillons. Cela pourrait expliquer pourquoi les écouvillons en coton bon marché ont été exclus des directives des CDC et de l'OMS pour le diagnostic du SARS-CoV-2 (Center for Diseases Control Prevention, 2020 ; OMS, 2020a). Valeurs Ct RT-qPCR pour les sondes N1, N2 et RNaseP pour les échantillons nasopharyngés avec des écouvillons en coton et en rayonne (moyenne +/– écart-type).

Ces résultats suggèrent que l'utilisation de cotons-tiges standard pour le prélèvement buccal permet non seulement de réaliser des économies importantes, mais aussi une méthode plus fiable que les écouvillons médicaux. Les quatre écouvillons, sélectionnés après l'analyse de plus d'une centaine de modèles, ont montré une excellente concordance avec les témoins lors d'un essai clinique. De même principe que le coton-tige, un écouvillon utilisé pour le prélèvement nasopharyngé est constitué d'une fine tige en plastique recouverte, à une extrémité, d'un matériau adsorbant tel que du coton, du polyester ou du nylon floqué. (Certains manches d'écouvillons sont en fil de nichrome ou d'acier chromé.) Les matériaux utilisés pour un diagnostic spécifique peuvent varier selon le type de test.

Depuis le début de l'année 2020, la pandémie de COVID-19 s'est rapidement propagée de l'Asie à l'Europe et aux États-Unis, puis enfin à l'Afrique et à l'Amérique latine. Les systèmes de santé publique ont été mis à rude épreuve et débordés dans des pays en développement comme l'Équateur. Dans ce contexte, la capacité à réaliser des tests de dépistage du SARS-CoV-2 est limitée par le manque de matériel de laboratoire et de personnel qualifié. De plus, les recherches sur le SARS-CoV-2 pourraient être perturbées par des pénuries d'approvisionnement.

Cette technique de diagnostic est souvent utilisée en cas de suspicion de coqueluche, de diphtérie, de grippe et de nombreuses maladies attribuables à la famille des coronavirus, dont le SRAS, le MERS et la COVID-19. En combinant ces résultats et les nôtres, même de courts cotons-tiges stériles en plastique, comme ceux utilisés pour l'hygiène des oreilles, peuvent être la cause d'un manque d'écouvillons NP. Nous rapportons ici que la détection moléculaire du SARS-CoV-2 à l'aide d'un prélèvement NP à l'aide d'un coton-tige en plastique est aussi fiable que l'utilisation d'écouvillons en plastique à embout en fibres synthétiques comme la rayonne, considérée comme la référence par les CDC.

Certaines recherches ont démontré que les écouvillons floqués prélèvent un volume plus important de matériel d'échantillonnage que les écouvillons en fibres. Un écouvillon nasopharyngé est une technique permettant de prélever un échantillon de sécrétions nasales à l'arrière du nez et de la gorge. L'échantillon est ensuite analysé pour détecter la présence d'organismes ou d'autres marqueurs cliniques de la maladie.

Nous avons comparé trois types d'écouvillons buccaux de qualité médicale à des cotons-tiges classiques afin de déterminer les variations de rendement en ADN. Un panel de types d'écouvillons – un de qualité pharmaceutique (Q-ideas®) et trois de qualité médicale – a été utilisé pour la collecte de cellules buccales chez trois personnes différentes. L'ADN a été extrait de tous les écouvillons à l'aide d'un robot QIAcube ; les valeurs de quantification ont été mesurées par un test qPCR à base d'Alu ; et les variations ont été comparées par une ANOVA à deux facteurs. Nos résultats révèlent que les cotons-tiges récupèrent autant d'ADN que les écouvillons de qualité médicale, mais à un coût nettement inférieur. Les cotons-tiges affichent également la plus grande constance en termes de rendement en ADN, comme l'indique le coefficient de variation le plus faible parmi les quatre types d'écouvillons testés.