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Il limite principale dello studio è la dimensione relativamente piccola del pattern, che spiegherebbe la concordanza del 100% tra i tamponi. Tuttavia, riteniamo che una potenziale discrepanza tra i tamponi in uno studio con una dimensione del pattern elevata possa essere correlata alla variabilità legata alla procedura di campionamento più che al tipo di tampone. Sebbene i nostri risultati dimostrino che il cotone non inibisce il rilevamento del SARS-COV-2, studi precedenti hanno dimostrato l'inibizione da parte delle sostanze chimiche presenti nel gambo di legno di alcuni tamponi. Questo potrebbe spiegare perché i tamponi di cotone economici sono stati esclusi dalle linee guida CDC e OMS per la diagnosi di SARS-CoV-2 (Center for Diseases Control Prevention, 2020; WHO, 2020a). Valori Ct RT-qPCR per sonde N1, N2 e RNaseP per campioni nasofaringei con tamponi di cotone e rayon (media +/- DS).
Questi risultati suggeriscono che l'utilizzo di tamponi di cotone standard per il prelievo di cellule buccali non solo offre un notevole risparmio economico, ma anche una tecnica più affidabile rispetto all'utilizzo di tamponi di grado medico. I quattro tamponi, selezionati dopo l'analisi di oltre cento modelli, hanno mostrato un'eccellente concordanza con i controlli in uno studio clinico. Simile nella concezione al tampone di cotone, un tampone utilizzato per la raccolta nasofaringea è costituito da un bastoncino sottile costituito da una corta asta di plastica rivestita, su una punta, con materiale assorbente come cotone, poliestere o nylon floccato. (Alcuni manici di tamponi sono realizzati in filo di nichelcromo o acciaio cromato.) I materiali dei tamponi utilizzati per una specifica applicazione diagnostica possono variare in base al tipo di test.
Dall'inizio del 2020, la pandemia di COVID-19 si è diffusa rapidamente dall'Asia all'Europa e agli Stati Uniti, ma anche in Africa e America Latina. Le misure di sanità pubblica sono state messe a dura prova e sono state sopraffatte in paesi in via di sviluppo come l'Ecuador. In questo contesto, la capacità di eseguire test per il SARS-CoV-2 è limitata a causa della mancanza di attrezzature di laboratorio e di personale qualificato. Inoltre, le analisi per il SARS-CoV-2 potrebbero essere interrotte a causa della carenza di risorse.
Questa tecnica diagnostica è spesso utilizzata in casi sospetti di pertosse, difterite, influenza e numerosi tipi di malattie attribuibili alla famiglia di virus coronavirus, tra cui SARS, MERS e COVID-19. Considerando congiuntamente questa scoperta e la nostra, anche i tamponi sterili di cotone con punta corta in plastica, come quelli utilizzati per l'igiene auricolare, possono rappresentare un'alternativa in assenza di tamponi NP. In questo articolo segnaliamo che il rilevamento molecolare del SARS-CoV-2 mediante campionamento NP con tamponi di cotone con punta in plastica è affidabile quanto l'utilizzo di tamponi di plastica con punta in fibre sintetiche come il rayon, considerati il gold standard dal CDC.
Alcune ricerche hanno dimostrato che i tamponi floccati acquisiscono un volume maggiore di materiale di rivestimento rispetto ai tamponi in fibra. Il tampone nasofaringeo è una tecnica per raccogliere un campione di secrezioni nasali dalla parte posteriore del naso e della gola. Il campione viene quindi analizzato per la presenza di microrganismi o altri marcatori clinici di malattia.
Abbiamo confrontato tre tipi di tamponi buccali di grado medicale con normali tamponi di cotone per valutare le variazioni nella resa del DNA. Un pannello di tipi di tamponi – uno da farmacia (Q-ideas®) e tre di grado medicale – è stato utilizzato per la raccolta di cellule buccali da tre pazienti diversi. Il DNA è stato estratto da tutti i tamponi utilizzando un robot QIAcube; i valori di quantificazione sono stati misurati mediante un test qPCR basato su Alu; e le variazioni sono state confrontate tramite un'ANOVA a due vie. I nostri risultati mostrano che i tamponi di cotone recuperano tanto DNA quanto i tamponi di grado medicale, ma a un costo notevolmente inferiore. I tamponi di cotone mostrano anche la maggiore costanza nella resa del DNA, come indicato dal coefficiente di variazione più basso tra i quattro tipi di tamponi testati.
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