Controllo delle infezioni nella pratica clinica aggiornato

A seconda delle istruzioni del produttore, la preparazione della libreria di sequenziamento shotgun inizia con 0,01–10 ng per campione. La massa totale di DNA recuperata nelle frazioni VLP (fago + batterico, come determinato mediante qPCR) variava da 0,63 ± 0,04 ng (da un campione contenente originariamente 1,9 × 108 virioni) fino a 1,2 ± 0,09 pg (da un campione contenente originariamente 1,9 × 105 virioni) (Fig. 2a).

Non è stata osservata alcuna differenza significativa nelle diluizioni delle macchie di sangue o saliva elaborate con la PCR diretta modificata, ma la completezza del profilo e l'RFU totale sono stati complessivamente migliorati rispetto alle macchie tamponate con tamponi di cotone o 4N6FLOQSwabs™. Questa ricerca supporta l'ipotesi che il tampone diretto microFLOQ® sia in grado di acquisire piccole quantità di DNA dal cotone e potrebbe anche essere considerato come una metodologia di pre-screening alternativa nell'ambito della biologia forense. Il kit di raccolta virus è progettato per la raccolta, il trasporto e la conservazione rapida di DNA/RNA totale in campioni medici come saliva, sangue, siero, feci e fluidi corporei, ecc. Il conservante lisa i microrganismi e inattiva cellule, batteri e virus.

Un prerequisito per l'utilizzo dell'analisi del microbiota come strumento scientifico è un campionamento e una conservazione efficienti e coerenti dei campioni. Un aspetto importante a questo proposito è l'impatto della gestione del campione e l'effetto della preparazione intestinale mediante la pulizia intestinale sulla composizione del microbiota nelle feci e nell'intestino. I tamponi FLOQSwabs® dal design anatomico sono stati sviluppati grazie a una stretta collaborazione con medici e microbiologi scientifici e a un impegno costante per ottimizzare l'efficacia della raccolta e del trasporto dei campioni preanalitici. I risultati sono un'efficacia e una riproducibilità ottimizzate della gamma di analiti target, una dinamica di movimento e una sensibilità del test migliorate e capacità di test ampliate.

Con il continuo aumento dei casi di COVID-19 a livello globale, test facilmente reperibili e affidabili sono fondamentali per individuare e rallentare la diffusione della malattia. Tuttavia, stiamo riscontrando difficoltà specifiche nella nostra catena di fornitura che limitano le nostre capacità di test, in particolare la raccolta dei campioni. Questa sfida, tuttavia, rappresenta un'opportunità per il mondo scientifico di ripensare il nostro approccio alle tecnologie di raccolta dei campioni. Amplificazione PCR diretta del DNA da macchie di sangue umano, saliva e campioni tattili raccolti con tamponi microFLOQ®. Il tampone microFLOQ® Direct Swab è stato analizzato campionando macchie diluite di sangue, sperma e saliva depositate su tessuto di cotone.

La tipizzazione del DNA è stata eseguita utilizzando il sistema PowerPlex® Fusion 6C mediante PCR diretta o PCR diretta modificata. La PCR diretta dei tamponi campionati al centro di una colorazione, rispetto ai rispettivi campionamenti ai bordi, ha mostrato una maggiore completezza del profilo e elementi fluorescenti relativi completi per tutte le diluizioni delle colorazioni di sangue e sperma esaminate. La PCR diretta modificata ha utilizzato DNA stampo eluito dalla testa del tampone utilizzando il kit Casework Direct, Custom e lavaggi contenenti additivo 1-tioglicerolo o privi di TG. La PCR diretta modificata ha prodotto risultati combinati per le colorazioni di sangue, saliva e sperma, con le colorazioni di sperma che hanno mostrato importanti differenze nella completezza del profilo (5% e 1%) e nella RFU completa (puro, 5% e 1%) con l'aggiunta di TG al reagente Casework Direct.

La ricerca sulla composizione del microbiota intestinale in condizioni di salute e malattia è cresciuta notevolmente dall'introduzione di approcci molecolari per la sua caratterizzazione. Dalle numerose ricerche condotte in questo campo, si stanno accumulando prove che la composizione del microbiota intestinale possa essere correlata a stati di malattia, in particolare nelle malattie infiammatorie intestinali, nell'obesità e nella malnutrizione.

I campioni salvati possono essere utilizzati in successivi esperimenti scientifici, come l'estrazione di DNA/RNA, il test PCR o il sequenziamento. Il pacchetto è ideale per raccogliere campioni per l'identificazione del coronavirus e per studi successivi. SV e IAC hanno ideato il progetto, tutti gli autori hanno progettato gli esperimenti e il campionamento, SV e YHK hanno eseguito gli esperimenti, JD ha raccolto i campioni medici, SV, YHK e IAC hanno analizzato i dati, SV e IAC hanno scritto il manoscritto. Poiché questo protocollo è destinato a fornire campioni per il sequenziamento ad alta produttività, la massa totale recuperata è un parametro cruciale.