Control de infecciones en la práctica clínica (actualizado)

Según las instrucciones del fabricante, la preparación de la biblioteca de secuenciación shotgun comienza con 0,01–10 ng por muestra. La masa total de ADN recuperado en las fracciones VLP (fago + bacteria, determinada por qPCR) osciló entre 0,63 ± 0,04 ng (de una muestra que originalmente contenía 1,9 × 10⁻¹ viriones) y 1,2 ± 0,09 pg (de una muestra que originalmente contenía 1,9 × 10⁻¹ viriones) (Fig. 2a).

No se observó una diferencia significativa en la dilución de las manchas de sangre o saliva procesadas con la PCR directa modificada, pero la integridad del perfil y la RFU total mejoraron en general en comparación con las manchas obtenidas con hisopos de algodón o 4N6FLOQSwabs™. Esta investigación respalda la hipótesis de que el hisopo directo microFLOQ® puede obtener cantidades mínimas de ADN del algodón y podría considerarse una metodología alternativa de precribado en casos de biología forense. El kit de recolección de virus está diseñado para la recolección, el transporte y el almacenamiento rápido de ADN/ARN total en muestras médicas como saliva, sangre, suero, heces y fluidos corporales, entre otras. El conservante lisará los organismos e inactivará las células, bacterias y virus.

Un requisito previo para utilizar la evaluación de la microbiota como herramienta científica es el muestreo y la conservación eficientes y consistentes de las muestras. Un aspecto importante a este respecto es el efecto del manejo de las muestras y de la preparación intestinal mediante la limpieza intestinal en la composición de la microbiota en heces e intestinos. Los FLOQSwabs®, de diseño anatómico, se desarrollaron gracias a una estrecha colaboración con médicos y microbiólogos científicos, y a un esfuerzo incansable por optimizar la eficacia de la recolección y el transporte de muestras preanalíticas. Los resultados son una eficacia y una reproducibilidad optimizadas de la selección de analitos objetivo, una dinámica de flujo y una sensibilidad del ensayo mejoradas, y una mayor capacidad de análisis.

A medida que el número de casos de COVID-19 continúa aumentando a nivel mundial, es fundamental contar con pruebas fáciles de obtener y fiables para identificar y frenar la propagación de la enfermedad. Sin embargo, nos encontramos con problemas únicos en nuestra cadena de suministro que limitan nuestra capacidad de prueba, en particular la recolección de muestras. Este desafío, sin embargo, representa una oportunidad para que la comunidad científica reconsidere nuestro enfoque en las tecnologías de recolección de muestras. Amplificación directa por PCR de ADN a partir de manchas de sangre, saliva y muestras de contacto humanas recolectadas con hisopos microFLOQ®. El hisopo directo microFLOQ® se analizó tomando muestras de manchas diluidas de sangre, semen y saliva depositadas sobre un paño de algodón.

La tipificación de ADN se realizó utilizando el sistema PowerPlex® Fusion 6C mediante PCR directa o PCR directa modificada. La PCR directa de hisopos muestreó el centro de la mancha, en comparación con sus respectivos muestreos de borde, y mostró una mayor integridad del perfil y elementos fluorescentes relativos completos en todas las diluciones de manchas de sangre y semen examinadas. La PCR directa modificada utilizó ADN molde eluido del cabezal del hisopo con el kit Casework Direct, personalizado, y los lavados contenían aditivo de 1-tioglicerol o no contenían TG. La PCR directa modificada arrojó resultados combinados para manchas de sangre, saliva y semen, mostrando las manchas de semen diferencias importantes en la integridad del perfil (5% y 1%) y en la RFU completa (puro, 5% y 1%) con la adición de TG al reactivo Casework Direct.

La investigación sobre la composición de la microbiota intestinal en la salud y la enfermedad ha experimentado un auge desde la introducción de enfoques moleculares para su caracterización. A partir de las numerosas investigaciones realizadas en este campo, se acumulan evidencias de que la composición de la microbiota intestinal puede estar relacionada con estados patológicos, especialmente en enfermedades inflamatorias intestinales, obesidad y desnutrición.

Las muestras guardadas pueden utilizarse en experimentos científicos posteriores, como la extracción de ADN/ARN, las pruebas de PCR o la secuenciación. El paquete es ideal para recopilar muestras para la identificación del coronavirus y estudios posteriores. SV e IAC concibieron el proyecto, todos los autores diseñaron los experimentos y el muestreo, SV e YHK llevaron a cabo los experimentos, JD recolectó muestras médicas, SV, YHK e IAC analizaron la información, y SV e IAC redactaron el manuscrito. Dado que este protocolo está diseñado para proporcionar muestras para la secuenciación de alto rendimiento, la masa total recuperada es una métrica crucial.