أنابيب المسحة مع أعواد القطن

مؤشرات تنوع شانون مترابطة بشكل وثيق بين المسحات المكررة والمسحات المجمدة السريعة لجميع الشُعب. التنوع أقل في مجموعة AFFV في خزعات الغشاء المخاطي وعينات البراز مقارنةً بمسحات المستقيم. وأخيرًا، تباينت مسحات المستقيم وعينات البراز وخزعات الغشاء المخاطي من خلال ترابط السمات.

أولًا، قارنّا عينات المسحات بعينات خزعة الغشاء المخاطي المأخوذة بالتنظير القولوني لدى 32 شخصًا. كانت هذه الارتباطات منخفضة بشكل عام، وخاصةً لدى مجموعة AFFV. أظهرت أنماط البكتيريا العصوية تشابهًا أكبر إلى حد ما مع توزيع كبير لقيم R2.

في عينات مسحة المستقيم، يبدو أن التنوع أكبر قليلاً ضمن المجموعة غير المُجهّزة، وأن توزيع مؤشرات النطاق أقل قليلاً منه ضمن المجموعة المُجهّزة. لوحظ أن تنوع AFFV أعلى في مسحات المستقيم منه في عينات البراز.

عادةً ما كان ارتباط البكتيريا العصوية أكبر بقليل من ارتباطها بـ AFFV. في مجموعة مرضى داء الأمعاء الالتهابي الخارجي، كانت الارتباطات أكبر بشكل ملحوظ، خاصةً لدى البكتيريا العصوية، التي كان متوسط ​​R2 فيها مماثلاً لمتوسط ​​R2 المُسجل في عينات المسحات المكررة. أظهرت هذه البيانات أن عينات البراز تُشبه عينات المسحات، خاصةً لدى فصيلة البكتيريا العصوية، ولكن ليس لدى الأشخاص الذين خضعوا لتحضير الأمعاء.

بعد ذلك، قورنت نتائج مسحات المستقيم بنتائج البراز لدى تسعة عشر مريضًا من مجموعة تنظير القولون، وجميع المرضى العشرة في مجموعة مرضى داء الأمعاء الالتهابي الخارجيين. في مجموعة تنظير القولون، كانت الارتباطات بين نتائج مسحات المستقيم ونتائج البراز منخفضة بشكل عام، تمامًا مثل ارتباط عينات المسحات بعينات خزعة الغشاء المخاطي في هذه المجموعة من المرضى المُجهّزين.

أُجريت مقارنات بين جميع العينات بحساب معاملات الارتباط التربيعية لجميع أزواج العينات المتاحة. عند مقارنة مسحات مكررة مخزنة في RTF من مجموعة تنظير القولون بعينات مختلفة، استُخدمت متوسطات الملامح للمسحات المكررة. عُزل الحمض النووي من البراز أو خزعات الغشاء المخاطي كما هو موضح سابقًا. باختصار، بالنسبة لعينات الغشاء المخاطي، تضمنت الخطوة الأولى تحليل الأنسجة والبكتيريا باستخدام طقم QIAamp DNA mini Kit، يليه استخلاص الحمض النووي باستخدام جهاز عزل الحمض النووي الآلي NucliSENS easyMag (Biomérieux، Marcy l'Etoile، فرنسا).